Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J9

Echdc3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Echdc3Q9D7J9 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Echdc3Q9D7J9 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Echdc3Q9D7J9 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Echdc3Q9D7J9 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Echdc3Q9D7J9 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Echdc3Q9D7J9 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Echdc3Q9D7J9 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Echdc3Q9D7J9 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Echdc3Q9D7J9 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Echdc3Q9D7J9 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Echdc3Q9D7J9 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Echdc3Q9D7J9 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Echdc3Q9D7J9 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Echdc3Q9D7J9 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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