Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn23Q9D7D7 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms