Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttc9bQ9D6E4 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
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Ttc9bQ9D6E4 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
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Ttc9bQ9D6E4 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttc9bQ9D6E4 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
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Ttc9bQ9D6E4 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Ttc9bQ9D6E4 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttc9bQ9D6E4 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttc9bQ9D6E4 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttc9bQ9D6E4 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Ttc9bQ9D6E4 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Ttc9bQ9D6E4 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Ttc9bQ9D6E4 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ttc9bQ9D6E4 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ttc9bQ9D6E4 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ttc9bQ9D6E4 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ttc9bQ9D6E4 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Ttc9bQ9D6E4 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Ttc9bQ9D6E4 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ttc9bQ9D6E4 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ttc9bQ9D6E4 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ttc9bQ9D6E4 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ttc9bQ9D6E4 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ttc9bQ9D6E4 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ttc9bQ9D6E4 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ttc9bQ9D6E4 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ttc9bQ9D6E4 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ttc9bQ9D6E4 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ttc9bQ9D6E4 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ttc9bQ9D6E4 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ttc9bQ9D6E4 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ttc9bQ9D6E4 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ttc9bQ9D6E4 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms