Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdr42e1Q9D665 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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