Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

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Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lonrf3Q9D4H7 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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