Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syce1Q9D495 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms