Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms