Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed11Q9D2R4 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.2 ms