Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zbed3Q9D0L1 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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