Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab3bQ9CZT8 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab3bQ9CZT8 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab3bQ9CZT8 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab3bQ9CZT8 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab3bQ9CZT8 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab3bQ9CZT8 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab3bQ9CZT8 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab3bQ9CZT8 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab3bQ9CZT8 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab3bQ9CZT8 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab3bQ9CZT8 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab3bQ9CZT8 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3bQ9CZT8 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3bQ9CZT8 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3bQ9CZT8 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3bQ9CZT8 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3bQ9CZT8 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3bQ9CZT8 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3bQ9CZT8 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3bQ9CZT8 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3bQ9CZT8 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3bQ9CZT8 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3bQ9CZT8 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3bQ9CZT8 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3bQ9CZT8 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3bQ9CZT8 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3bQ9CZT8 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3bQ9CZT8 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3bQ9CZT8 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3bQ9CZT8 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3bQ9CZT8 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3bQ9CZT8 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3bQ9CZT8 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3bQ9CZT8 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3bQ9CZT8 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3bQ9CZT8 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3bQ9CZT8 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3bQ9CZT8 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3bQ9CZT8 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3bQ9CZT8 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3bQ9CZT8 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3bQ9CZT8 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3bQ9CZT8 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3bQ9CZT8 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3bQ9CZT8 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3bQ9CZT8 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3bQ9CZT8 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3bQ9CZT8 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3bQ9CZT8 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3bQ9CZT8 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3bQ9CZT8 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3bQ9CZT8 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3bQ9CZT8 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3bQ9CZT8 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3bQ9CZT8 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3bQ9CZT8 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Rab3bQ9CZT8 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab3bQ9CZT8 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab3bQ9CZT8 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab3bQ9CZT8 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab3bQ9CZT8 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab3bQ9CZT8 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab3bQ9CZT8 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab3bQ9CZT8 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab3bQ9CZT8 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab3bQ9CZT8 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab3bQ9CZT8 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab3bQ9CZT8 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab3bQ9CZT8 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab3bQ9CZT8 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab3bQ9CZT8 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab3bQ9CZT8 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab3bQ9CZT8 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab3bQ9CZT8 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab3bQ9CZT8 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab3bQ9CZT8 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab3bQ9CZT8 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab3bQ9CZT8 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab3bQ9CZT8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab3bQ9CZT8 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab3bQ9CZT8 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab3bQ9CZT8 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab3bQ9CZT8 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab3bQ9CZT8 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab3bQ9CZT8 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab3bQ9CZT8 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab3bQ9CZT8 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab3bQ9CZT8 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab3bQ9CZT8 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab3bQ9CZT8 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab3bQ9CZT8 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab3bQ9CZT8 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab3bQ9CZT8 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab3bQ9CZT8 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab3bQ9CZT8 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab3bQ9CZT8 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab3bQ9CZT8 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab3bQ9CZT8 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab3bQ9CZT8 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms