Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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MINDY3Q9CV28 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MINDY3Q9CV28 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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