Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms