Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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