Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS8

Sec61b, Protein transport protein Sec61 subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec61bQ9CQS8 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Gm43158-201ENSMUST00000198484 1555 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 A630009H07Rik-201ENSMUST00000208485 2159 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Adh6-ps1-201ENSMUST00000171054 2789 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Smgc-204ENSMUST00000109277 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Homer1-208ENSMUST00000109495 813 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Csn1s2b-203ENSMUST00000113279 745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Trim30e-ps1-202ENSMUST00000151294 731 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Olfr721-ps1-201ENSMUST00000165291 975 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 1700003H04Rik-206ENSMUST00000180162 1086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Celrr-201ENSMUST00000181183 1194 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 1600010M07Rik-201ENSMUST00000185931 1204 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Gm18717-201ENSMUST00000192744 1241 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Gm38133-201ENSMUST00000195109 815 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Gm42696-201ENSMUST00000199859 1142 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Olfr8-202ENSMUST00000203851 1009 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 1700102F20Rik-201ENSMUST00000203859 670 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Olfr721-ps1-202ENSMUST00000206688 1097 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Csn1s2b-201ENSMUST00000072539 810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sec61bQ9CQS8 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms