Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
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Nicn1Q9CQM0 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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Nicn1Q9CQM0 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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Nicn1Q9CQM0 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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Nicn1Q9CQM0 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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Nicn1Q9CQM0 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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Nicn1Q9CQM0 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
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Nicn1Q9CQM0 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
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Nicn1Q9CQM0 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
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