Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rwdd1Q9CQK7 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms