Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Chmp3Q9CQ10 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Chmp3Q9CQ10 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Chmp3Q9CQ10 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Chmp3Q9CQ10 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Chmp3Q9CQ10 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Chmp3Q9CQ10 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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