Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim3Q99PE5 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms