Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms