Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Rcbtb2Q99LJ7 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Rcbtb2Q99LJ7 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Rcbtb2Q99LJ7 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Rcbtb2Q99LJ7 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rcbtb2Q99LJ7 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms