Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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Sh3bp5lQ99LH9 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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Sh3bp5lQ99LH9 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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Sh3bp5lQ99LH9 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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Sh3bp5lQ99LH9 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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Sh3bp5lQ99LH9 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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Sh3bp5lQ99LH9 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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Sh3bp5lQ99LH9 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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Sh3bp5lQ99LH9 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
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Sh3bp5lQ99LH9 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
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Sh3bp5lQ99LH9 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Sh3bp5lQ99LH9 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Sh3bp5lQ99LH9 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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