Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
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TrabdQ99JY4 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
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TrabdQ99JY4 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
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TrabdQ99JY4 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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TrabdQ99JY4 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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TrabdQ99JY4 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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TrabdQ99JY4 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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TrabdQ99JY4 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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TrabdQ99JY4 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TrabdQ99JY4 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.1 ms