Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pacsin3Q99JB8 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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