Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Smim11aQ99J19 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Smim11aQ99J19 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Smim11aQ99J19 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Smim11aQ99J19 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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