Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Gm15976-201ENSMUST00000129701 429 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfdQ925I7 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms