Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Rnf144aQ925F3 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Rnf144aQ925F3 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Rnf144aQ925F3 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Rnf144aQ925F3 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Rnf144aQ925F3 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rnf144aQ925F3 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rnf144aQ925F3 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rnf144aQ925F3 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Rnf144aQ925F3 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf144aQ925F3 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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