Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Med28Q920D3 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms