Protein–RNA interactions for Protein: Q91W59

Rbms1, RNA-binding motif, single-stranded-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbms1Q91W59 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Rbms1Q91W59 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Rbms1Q91W59 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Rbms1Q91W59 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Rbms1Q91W59 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Rbms1Q91W59 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rbms1Q91W59 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms