Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn4Q8VCH8 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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