Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms