Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms