Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Fcho1Q8K285 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Fcho1Q8K285 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms