Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pkn3Q8K045 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pkn3Q8K045 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pkn3Q8K045 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pkn3Q8K045 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pkn3Q8K045 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pkn3Q8K045 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pkn3Q8K045 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pkn3Q8K045 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pkn3Q8K045 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pkn3Q8K045 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pkn3Q8K045 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Pkn3Q8K045 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pkn3Q8K045 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pkn3Q8K045 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pkn3Q8K045 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pkn3Q8K045 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pkn3Q8K045 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Pkn3Q8K045 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Pkn3Q8K045 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pkn3Q8K045 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pkn3Q8K045 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Pkn3Q8K045 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pkn3Q8K045 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pkn3Q8K045 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pkn3Q8K045 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pkn3Q8K045 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pkn3Q8K045 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pkn3Q8K045 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pkn3Q8K045 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pkn3Q8K045 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms