Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Znf628Q8CJ78 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Znf628Q8CJ78 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Znf628Q8CJ78 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Znf628Q8CJ78 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Znf628Q8CJ78 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Znf628Q8CJ78 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Znf628Q8CJ78 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Znf628Q8CJ78 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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