Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms