Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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SbsnQ8CIT9 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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SbsnQ8CIT9 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
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SbsnQ8CIT9 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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