Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Card11Q8CIS0 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Card11Q8CIS0 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Card11Q8CIS0 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Card11Q8CIS0 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Card11Q8CIS0 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Card11Q8CIS0 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Card11Q8CIS0 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Card11Q8CIS0 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Card11Q8CIS0 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms