Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Rab11fip3Q8CHD8 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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Rab11fip3Q8CHD8 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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