Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc43a2Q8CGA3 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms