Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Brf1Q8CFK2 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Brf1Q8CFK2 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Brf1Q8CFK2 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Brf1Q8CFK2 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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