Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh13Q8CEE7 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms