Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrif1Q8CDD9 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms