Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms