Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms