Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms