Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0T0

Xkr8, XK-related protein 8, mousemouse

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Length 401 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xkr8Q8C0T0 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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Xkr8Q8C0T0 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Xkr8Q8C0T0 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Xkr8Q8C0T0 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Xkr8Q8C0T0 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Xkr8Q8C0T0 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xkr8Q8C0T0 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Xkr8Q8C0T0 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xkr8Q8C0T0 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Xkr8Q8C0T0 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xkr8Q8C0T0 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xkr8Q8C0T0 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xkr8Q8C0T0 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xkr8Q8C0T0 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xkr8Q8C0T0 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xkr8Q8C0T0 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Xkr8Q8C0T0 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Xkr8Q8C0T0 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Xkr8Q8C0T0 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xkr8Q8C0T0 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Xkr8Q8C0T0 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xkr8Q8C0T0 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xkr8Q8C0T0 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Xkr8Q8C0T0 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xkr8Q8C0T0 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xkr8Q8C0T0 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Xkr8Q8C0T0 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xkr8Q8C0T0 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xkr8Q8C0T0 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xkr8Q8C0T0 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xkr8Q8C0T0 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xkr8Q8C0T0 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Xkr8Q8C0T0 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xkr8Q8C0T0 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xkr8Q8C0T0 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Xkr8Q8C0T0 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Xkr8Q8C0T0 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xkr8Q8C0T0 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xkr8Q8C0T0 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xkr8Q8C0T0 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xkr8Q8C0T0 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xkr8Q8C0T0 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xkr8Q8C0T0 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xkr8Q8C0T0 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xkr8Q8C0T0 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xkr8Q8C0T0 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xkr8Q8C0T0 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xkr8Q8C0T0 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xkr8Q8C0T0 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xkr8Q8C0T0 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Xkr8Q8C0T0 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Xkr8Q8C0T0 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xkr8Q8C0T0 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Xkr8Q8C0T0 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xkr8Q8C0T0 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xkr8Q8C0T0 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xkr8Q8C0T0 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xkr8Q8C0T0 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xkr8Q8C0T0 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xkr8Q8C0T0 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xkr8Q8C0T0 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xkr8Q8C0T0 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xkr8Q8C0T0 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xkr8Q8C0T0 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xkr8Q8C0T0 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Xkr8Q8C0T0 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
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Xkr8Q8C0T0 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms