Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Ctdsp2Q8BX07 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Ctdsp2Q8BX07 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
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Ctdsp2Q8BX07 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Ctdsp2Q8BX07 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Ctdsp2Q8BX07 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Ctdsp2Q8BX07 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
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