Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp38Q8BW70 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Usp38Q8BW70 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Usp38Q8BW70 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Usp38Q8BW70 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Usp38Q8BW70 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Usp38Q8BW70 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Usp38Q8BW70 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Usp38Q8BW70 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Usp38Q8BW70 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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