Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms