Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ33

Ticrr, Treslin, mousemouse

Predictions only

Length 1,889 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TicrrQ8BQ33 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TicrrQ8BQ33 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TicrrQ8BQ33 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TicrrQ8BQ33 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TicrrQ8BQ33 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TicrrQ8BQ33 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TicrrQ8BQ33 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TicrrQ8BQ33 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TicrrQ8BQ33 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TicrrQ8BQ33 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TicrrQ8BQ33 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TicrrQ8BQ33 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms